拟南芥中的乙酰化修饰

周琪婷; 何崇圣

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拟南芥中的乙酰化修饰

首发时间：2023-04-21

周琪婷 ¹
1997-,女，研究方向：表观遗传学
何崇圣 ¹
1985-,男，教授，博导，研究方向：植物基因挖掘

1、湖南大学生物学院植物功能基因组学与发育调控湖南省重点实验室长沙 4100082

摘要：N4-乙酰脱氧胞嘧啶(ac4C)最近被发现是mRNA上的一种新的修饰。ac4C修饰被证明是RNA稳定性、RNA翻译和热应激反应的关键调节因子。但其在真核生物mRNA上的存在仍存在争议。在植物中，ac4C的存在、分布模式和潜在功能尚不清楚。在这里，我们报道了ac4C在拟南芥 mRNA上的存在。通过比较两种ac4C测序方法，我们发现acRIP-seq适合植物ac4C测序，而ac4C-seq不适合。我们展示了通过acRIP-seq获得的拟南芥mRNA中ac4C的转录组全图谱。ac4C分布分析表明，拟南芥mRNA中ac4C富集在翻译起始位点和翻译结束位点附近。

关键词：拟南芥 ac4C 表观遗传学

For information in English, please click here

RNA N4-cytidine acetylation in Arabidopsis thaliana

ZHOU Qiting ¹
1997-,女，研究方向：表观遗传学
HE Chongsheng ¹
1985-,男，教授，博导，研究方向：植物基因挖掘

1、Hunan Province Key Labratory of Plant Functional Genomics and Developmental Regulation,College of Biology,Hunan University,changsha,410082

Abstract：RNA acetylation on N4-cytidine (ac4C) has recently been discovered as a novel modification on mRNA. The ac4C modification was shown to be a key regulator of RNA stability, RNA translation, and the thermal stress response. However, its existence on eukaryotic mRNA is still controversial. In plants, the existence, distribution pattern and potential function of ac4C are largely unknown. Here we report the presence of ac4C on the mRNA of both Arabidopsis thaliana . By comparing two ac4C sequencing methods, we found that acRIP-seq but not ac4C-seq was suitable for plant ac4C sequencing. We present transcriptome-wide atlases of ac4C in Arabidopsis thaliana mRNAs obtained by acRIP-seq. Analysis of ac4C distribution showed that the ac4C concentration in Arabidopsis mRNA was near the start and end sites of translation.

Keywords： Arabidopsis thaliana N4-acetylcytidine, Epitranscriptomics

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周琪婷，何崇圣. 拟南芥中的乙酰化修饰[EB/OL]. 北京：中国科技论文在线 [2023-04-21]. http://www.yfrlel.com/releasepaper/content/202304-292.

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论文编号	202304-292
论文题目	拟南芥中的乙酰化修饰
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