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        论文编号 202304-376
        论文题目 四种主要布鲁氏菌类群的全球系统发育和进化史
        文献类型
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        中外文作者均姓前名后,姓大写,名的第一个字母大写,姓全称写出,名可只写第一个字母,其后不加实心圆点“.”,

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        四种主要布鲁氏菌类群的全球系统发育和进化史

        首发时间:2023-04-28

        杨雨 1   

        杨雨(1998 - ),男,主要研究方向:布鲁氏菌的遗传进化

        李恒 1   

        李恒(1990—),男,主要研究方向:病原微生物(金黄色葡萄球菌)毒力与抗生素耐药性的生物信息学分析

        周哲敏 1   

        周哲敏(1982-),男,教授、博导,主要研究方向:古代微生物宏基因组学、微生物群体遗传学及生物信息学研究

        • 1、苏州大学巴斯德学院,苏州 215004

        摘要:布鲁氏菌病是由布鲁氏菌引起的一种严重的人畜共患疾病,对全世界的公共卫生构成了重大威胁。尽管不同种类的布鲁氏菌在基因组水平上显示高度遗传相似性,它们仍然表现出不同的宿主偏好、人畜共患风险和毒力。为了更好地了解这种病原体的遗传多样性,我们从公共数据库中一共筛选出1999个菌株,代表了四个主要布鲁氏菌种群的结构,并进行了系统发育分析。我们构建了核心SNP系统发育树并通过PopPunk软件对布鲁氏菌的种群结构进一步细分。接着使用贝叶斯推断对布鲁氏菌的全球进化和系统地理传播进行了分析。我们发现其最近的共同祖先可以追溯到大约公元前5565年。这表明,这些全球主要种群布鲁氏菌株的遗传多样化可能与早期牲畜的驯化和分布有关。此外,伴随着公元1000年开始的全球化,以及近400年内全球联系的逐步加强,四种主要类群的布鲁氏菌株出现了群体扩展和全球传播加速并在各自的品系中发生了快速的亚型分化。这为我们深入了解布鲁氏菌的进化和传播提供了重要的参考,有助于制定更好的预防和控制布鲁氏菌感染的策略。

        关键词: 布鲁氏菌 系统发育 时间进化 地理传播

        For information in English, please click here

        Global phylogeny and evolutionary history of four major Brucella species

        YANG Yu 1   

        杨雨(1998 - ),男,主要研究方向:布鲁氏菌的遗传进化

        LI Heng 1   

        李恒(1990—),男,主要研究方向:病原微生物(金黄色葡萄球菌)毒力与抗生素耐药性的生物信息学分析

        ZHOU Zhemin 1   

        周哲敏(1982-),男,教授、博导,主要研究方向:古代微生物宏基因组学、微生物群体遗传学及生物信息学研究

        • 1、Pasteurien College,Soochow University,Suzhou 215004

        Abstract:rucellosis is a serious zoonotic disease caused by Brucella species, posing a significant threat to public health worldwide. Although different Brucella species show high genetic similarity at the genomic level, they still exhibit different host preferences, zoonotic risks, and virulence. To better understand the genetic diversity of this pathogen, we selected a total of 1999 strains representing the four major Brucella species from public databases, and performed phylogenetic analysis based on whole genome sequencing. We constructed the core SNPs based phylogenetic tree and subdivided the Brucella population using the PopPunk software. We then used Bayesian inference to analyze the global evolution and systematic geographic spread of Brucella. We found that their most recent common ancestor could be traced back to approximately 5565 BC, suggesting that the genetic diversification of these major global Brucella lineages may be related to the early domestication and distribution of livestock. In addition, with the globalization since around AD 1000 and the further strengthening of global connections in the past two centuries, the four major Brucella lineages have undergone rapid subtype differentiation and population expansion, accompanied by accelerated global dissemination within their respective lineages. Our study provides important insights into the evolution and transmission of Brucella, which can aid in the development of better prevention and control strategies against Brucella .

        Keywords: Brucella phylpgeny temporal evolution geographic dissemination

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        杨雨,李恒,周哲敏. 四种主要布鲁氏菌类群的全球系统发育和进化史[EB/OL]. 北京:中国科技论文在线 [2023-04-28]. http://www.yfrlel.com/releasepaper/content/202304-376.

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